Cursos de Graduação: cada curso possui um Núcleo Docente Estruturante – NDE e um Comitê Assessor que são órgãos consultivos.
Programas de Pós-Graduação: cada programa possui um colegiado que é um órgão consultivo.
Laboratórios: Arqueologia: ARISE - Laboratório Arqueologia Interativa e Simulações Eletrônicas; HECATEU - Laboratório de História e Cartografia Americana, Territórios, Espaço e Urbanismo; LAPEEX - Laboratório de Arqueologia e Pré-História Evolutiva e Experimental; L'ARTE - Laboratório de Arqueologia das Técnicas e Etnoarqueologia; LASCA - Laboratório de Aprendizagem com Seres, Coisas e Ambientes; LEAB - Laboratório de Estudos em Antropologia Biológica, Bioarqueologia e Evolução Humana; e RTA LEPAN - Reserva Técnica de Arqueologia. Arquivologia: LArq - Laboratório de Ensino, Pesquisa e Extensão em Arquivologia; LCarq - Laboratório de Conservação de Documentos; e LTArq - Laboratório de Tecnologia da Informação do Curso de Arquivologia. Biblioteconomia: LABER - Laboratório de Editoração Eletrônica e Repositórios; LABCOINFO - Laboratório de Competências Informacionais; LTI - Laboratório de Tecnologia da Informação Documentária; e BL - Biblioteca Laboratório. Ciências Sociais: AD - Ateliê da Democracia; Ìmọ - Laboratório de Estudos sobre Relações Étnico-Raciais; e LAPECS - Laboratório de Pesquisa e Ensino em Ciências Sociais. Geografia: ARCA - Núcleo de Estudos Agrários e Culturais; LaCCa - Laboratório de Climatologia e Cartografia; LAPEG - Laboratório de Pesquisa e Ensino em Geografia; LG - Laboratório de Geoprocessamento; LGRH - Laboratório de Geomorfologia e Recursos Hídricos; NAUC - Núcleo de Análises Urbanas e Culturais; e (R)EAT - Núcleo de Ensino, Pesquisa e Extensão (R)Existências Ambientais e Territoriais. História: CDH/FURG - Centro de Documentação Histórica "Prof. Hugo Alberto Pereira Neves" ; LABEHI - Laboratório de Ensino de História; LAHIS - Laboratório de História, Imagem e Som; e LAPEDHI - Laboratório de Pesquisa e Ensino em Didática da História. Hotelaria: LAHOSP - Laboratório de Hospedagem. Psicologia: CAP/FURG - Clínica de Atendimento Psicológico da FURG; CEP/RUA - Centro de Estudos Psicológicos sobre Meninos e Meninas de Rua; CERIS - Centro de Estudos sobre Risco e Saúde; CTDIPO - Laboratório Clínicas do Trabalho, Diversidade, Inclusão e Processos Organizacionais; GESCEM - Laboratório Grupo de Estudos em Saúde Coletiva dos Ecossistemas Costeiros e Marítimos; LAPEPSO - Laboratório de Pesquisa e Estudos em Psicologia Social; LEXPARTE - Laboratório de Pesquisa e Extensão sobre Psicanálise e Arte; LNS - Laboratório de Neurociência Social; NETCOS - Núcleo de Estudos do Trabalho e Constituição do Sujeito; NUPPADES - Núcleo de Pesquisa sobre Psicanálise, Arte e Desenvolvimento Humano; e VIVAZ - Laboratório Grupo de Estudos Interfaces em Psicologia e Saúde. Tecnologia em Eventos: LA&B - Laboratório de Alimentos e Bebidas; e LAPPE - Laboratório de Pesquisa e Planejamento em Eventos. Turismo: LATUR - Laboratório de Pesquisa em Turismo.